黑枸杞中含有红枸杞所没有的天然原花青素，其原花青素含量超过蓝莓(黑果枸杞含OPC 3690mg/100g;蓝莓含OPC 330～3380mg/100g)，这也会黑枸杞呈黑色的原因。
一般正宗的黑枸杞都是野生的，颗粒比较小，是偏圆形的黑色果实，带有一个小的果柄。
而红枸杞是扁长形的红色果实，而且一般没有果柄。
由于黑枸杞中特有的原花青素是一种热敏性活性物质，温度太高花青素会分解，因此在泡黑枸杞时要用60度以下的温水或者是冷水冲泡。
而红枸杞不怕高温，其可以直接嚼食、泡水、泡酒、熬汤等。
黑枸杞和红枸杞除了颜色之外最大的差异便是价格相差比较大。
黑枸杞由于产量少，营养价值高，已经的价格从几百元到几千元一斤不等。
而红枸杞的价格一般在几十元一斤到一百元左右一斤不等。
