妊娠期妇女一般在妊娠后3个月，甲胎蛋白就明显升高，到7-8月孕妇母血中甲胎蛋白量达到最高峰并相对稳定，但其仍然低400ng/ml，约在产后3周后逐渐恢复正常水平。
孕期通过甲胎蛋白的多少还可判断胎儿是否存在发育缺陷，比如神经管缺陷、脊柱裂、无脑等。
甲胎蛋白是胎儿血浆蛋白的重要组成部分，所以，新生儿身体里面的甲胎蛋白暂时会比较高。但其也不是一直偏高，而是在出生后不断下降，出生12-18个月时，达到正常水平。
患有酒精性肝炎、肝硬化、急性病毒性肝炎、慢性活动性肝炎、肠炎及遗传性酪氨酸血症等疾病的朋友，血清中的甲胎蛋白含量也会偏高，此时可呈中低水平的增高，或者反复性升高，检测结果多小于400ng/ml。
正常情况下，人体里面的甲胎蛋白含量可以忽略不计。但若是检查发现甲胎蛋白量很高，则要怀疑是否患上了肝癌疾病。
血清甲胎蛋白含量大于400ng/ml时，可辅助诊断原发性肝癌，其阳性率可达到60%-80%。
有研究数据显示，近一半得了生殖细胞肿瘤疾病的患者朋友他们体内的甲胎蛋白也会比较高。常见的瘤有内胚窦瘤、畸胎瘤及非精原细胞瘤。
血清甲胎蛋白结合人绒毛膜促性腺激素(HCG)可用于鉴别诊断精原细胞瘤和非精原细胞瘤。
