外伤性及炎症性尿道狭窄由于尿道阻力增加，导致射精时精液受阻。外伤性骨盆骨折常可引起后尿道损伤导致狭窄，同时骨折片又可破坏膀胱颈部的结构，致膀胱颈关闭功能不良造成逆行射精。另外，长期排尿困难亦可使膀胱颈部张力下降，导致关闭无力。
有很多先天性因素也会导致男性逆行射精，比如先天性宽膀胱颈，先天性尿道瓣膜或尿道憩室，先天性脊柱裂。这些先天性疾病使得膀胱颈半闭不全及尿道膜部阻力增加，造成逆行射精。
前列腺手术或经尿道膀胱颈阻塞切开术等损伤了膀胱颈部的肌肉和弹性纤维，膀胱颈部松弛，可致逆行性射精。另外，胸腰段交感神经切除术、盆腔手术、脊髓损伤等，也可造成膀胱颈功能丧失，引起逆行性射精。
服用a-肾上腺素能受体阻滞剂，如利血平、呱乙啶、盐酸甲硫哒嗪、苯甲呱及溴苄胺等都可引起平滑肌收缩无力而出现逆向射精。
包皮过长、包皮口狭窄使性交时嵌顿，产生疼痛而使性交中断。逆行射精是根本射不出来的，只要能射精，就不是逆行射精。至于精液量较少，可能与逆行射精次数过多有关。
有很多全身性的疾病也会导致男性逆行射精，比如糖尿病可并发逆向射精，脊髓损伤、膀胱结石、膀胱炎、尿道炎等使患者丧失排精能力或逆向射精，发病率较高。
