射精后腰痛最常见的疾病就是肾虚，除了腰痛肾虚还有性功能降低，男子性兴趣降低，性欲降低，阳痿或阳物举而不坚，遗精，滑精，早泄，显微镜检查可见精子减少或精子活动力减低，不育。早衰，健忘失眠，食欲不振，骨骼与关节疼痛，腰膝酸软，不耐疲劳，乏力，视力减退，听力衰减。肾虚的症状在泌尿方面表现为： 尿频，尿等待，小便清长等症状。
男人射精后腰痛还可能是泌尿系统感染引起的，腰痛以急、慢性肾盂肾炎所致者为多，表现为腰部胀痛、严重者沿输尿管放射至会阴部。除泌尿系统感染外，泌尿系结石、结核等疾患，亦会引起腰痛。
男人射精后腰痛还可能是腰肌劳损引起的，男性在性行为中需要不停的晃动腰部，如果长时间重复性生活的话，是容易造成腰肌劳损的。
腰椎病变也会引起男人射精后腰痛，随着年龄的增长，腰椎神经的压迫症状也会随之增多。因退行性病变引起的假性脊椎柱滑脱是较常见的一种病变，容易引起腰椎管狭窄，压迫脊髓和神经根，导致腰痛和下肢放射痛，往往是因骨质疏松所致的椎体塌陷性骨折。
