服用附子理中丸可能会出现大便增多的情况(中医认为是“足太阴脾经开在下”的表现，说明脾胃功能在恢复)。
也可能会出现食欲增加等脾胃功能改善的情况，甚至，可能会出现长痘痘等反应(身体阳气增加，推动寒湿循胃经排出体表的过程);
另外服用附子理中丸期间出现尿多，屁多，汗多，咳嗽，便秘或腹泻呕吐皆是排病反应。
附子理中丸所含的附子有一定的毒性，大剂量服用有可能会出现胃部消化不好、没有食欲、脱发等不良反应，如果出现以上不良反应可以减少用量或停止服用。比如只在晚上吃两粒，两天吃一次等。
1、有高血压、心脏病、肝病、糖尿病、肾病等慢性病严重者应在医师指导下服用。
2、感冒发热病人不宜服用。
3、吐泻严重者应及时去医院就诊。
4、孕妇慎用，哺乳期妇女、儿童应在医师指导下服用。
5、对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。
6、儿童必须在成人监护下使用。
