肛门有一个肛门齿线，齿线之上是粘膜，之下是皮肤。肛乳头瘤是在肛门齿线位置，就是在肛门里1.5~2厘米的位置，而直肠息肉一般都是在齿线之上的粘膜发生的。
肛乳头瘤是皮肤覆盖的，直肠息肉是粘膜覆盖的。肛乳头瘤就在齿线上，所以它是皮肤覆盖的，而直肠息肉一般都是粘膜下发生的，所以它不可能在外面，是在里面，直肠大概是12公分，这12公分的粘膜都可以发生。
息肉一般容易出血，肛乳头瘤是不出血的，因为它是皮肤覆盖的;息肉没有疼痛感，而肛乳头瘤有时有疼痛感觉。另外，需要注意的是肛乳头瘤不会癌变，息肉是有癌变可能的。
