腹痛是小儿肠套叠最常见的症状，但是由于宝宝自己不会详尽讲述，临床上可表现为突然发生哭闹、屈腿、面色苍白。
腹痛缓解时仍可玩嬉或入睡。反复发作后，患儿精神渐差、嗜睡、面色苍白、精神萎靡甚至出现休克。
呕吐常在腹痛发作后不久出现。呕吐物初为乳汁、乳块或食物残渣，以后带有胆汁，晚期可吐出粪便样液体。
在发病初期可有1～2次正常大便，以后便排出含血和粘液的粪便，像果酱样。
大多数患儿在起病后4～12小时出现这种带有特征性的果酱样大便。
少数婴儿来诊时无血便，仅肛门检查时手套上染有血迹。
由于腹部肠管发生了套叠，可引起局部隆起似肿块状。
在疾病早期，腹部可扪及肿物;到了晚期，由于脱水、电解质紊乱、腹胀、休克甚至出现腹膜炎征象，腹部肿块反而不容易查出。
