乙肝病毒是最主要的易于传播的肝炎病毒。肝炎病毒可通过乳汁传给婴儿。一般乙肝表面抗原阳性母亲的新生儿在24小时之内会注射乙型肝炎免疫球蛋白，接受免疫的宝宝无论是人工喂养还是母乳喂养，HBV感染率无明显差异。但若是乳母乳头皲裂、缺损，则应该避免直接母乳喂养，避免大量的HBV病毒进入乳汁，对婴儿产生影响。
HIV病毒能通过哺乳传播，在无任何干预措施的情况下HIV传染率达15%[1]。HIV病毒能够通过宝宝的口腔破溃及未发育成熟的胃肠进入宝宝体内。目前尚未找到针对艾滋病的免疫手段，因此人工喂养是最好的方式。
患有精神疾病乳母需要服用治疗精神疾病的药物或是抗惊厥的药物治疗，如苯巴比妥和安定，这些药物能够通过乳汁进入宝宝的体内，引起宝宝嗜睡、衰弱无力、恶心呕吐等不良反应，对其不利。
巴氏消毒法：又称低温消毒法。
既可杀死对健康有害的病原菌，又可使乳质尽量少发生变化。也就是根据对耐高温性极强的结核菌热致死曲线和乳质中最易受热影响的奶油分离性热破坏曲线的差异原理，在低温下长时间或高温下短时间进行加热处理的一种方法。其中，在60摄氏度一下加热30分钟的方式，作为低温灭菌的标准，早为世界广泛采用。
将乳汁放在62.5摄氏度的恒温箱内，30分钟进行消毒，即巴氏消毒法。此方法既除掉了母乳中的细菌，又没有破坏母乳中的成分，注意消毒时间不要超过30分钟。
