1、男性支原体感染后容易发生前列腺炎、附睾炎等，感染的结果，导致这些部位分泌液严重感染。
2、接影响精子的活力和动力，致使精子质量明显低下，死亡精子数目明显增加;具有受孕能力的精子数量减少，活动力降低、形态异常，有的能力低下或丧失，失去进入卵子并与其结合的能力;或直接导致不孕，或威胁人类的生殖质量和繁育能力。
女性感染的初期，一般会侵犯阴道、宫颈。这些器官发生炎症反应，致使分泌物增多。白带有异常气味，有的感到生殖道有轻微不适。
若得不到及时治疗便会继续感染。导致以下问题：
1、妇科炎症
女性支原体感染会给女性带来一些妇科炎症，其中最为常见的为宫颈炎，而如果不及时的进行治疗，其又可引发一些别的妇科炎症，如子宫内膜炎、输卵管炎、盆腔炎等。
2、不孕
支原体感染是引起女性不孕的一个常见因素，支原体感染常导致女性发生生殖道炎症，进而便可致使女性发生不孕，一些数据显示出，在不孕的女性中，约有九成可发生了支原体感染，相对比正常女性多了七成。
3、影响母婴健康
女性患有支原体感染怀孕了，或是在怀孕后患有支原体感染，则会增加一些如妊娠高血压综合征、羊水过多、早产、胎膜早破、绒毛膜炎和子宫内膜炎等问题的发生率，并且可感染至胎儿，增加胎儿畸形的几率，也可增加新生儿结膜炎、肺炎及先天性心脏病的发生率，不利母婴健康。
儿童支原体感染其实就是指肺炎支原体感染。宝宝如果患了肺炎支原体感染，就可能会有以下症状：
1、发烧畏寒。儿童支原体感染的症状首先表现为发烧，而且，这种发烧情况，患儿的体温一般在37～41℃，绝大多数儿童支原体感染发烧都在39℃左右，并且儿童支原体感染发烧常为持续性或弛张性。当然，还因个人体质不同，还有些儿童支原体感染仅有低烧，甚至不发烧。
2、咳嗽。多数儿童支原体感染咳嗽情况都比较严重，初期常表现为干咳，有时阵咳，有点像小儿百日咳。
3、咽喉疼痛。儿童支原体感染常常引发儿童咽喉疼痛，患儿会自我感觉疼痛继而表现出厌食、厌水的情况。
4、咳痰呕吐。儿童支原体感染最常见的症状之一是咳痰。患儿常咳白色清痰，偶尔略带血丝。当儿童咳嗽咳痰时也经常会伴随出现呕吐的症状。这可能会更加重患儿厌食不吃饭的情况。
5、头痛及胸骨下疼痛。儿童支原体感染患儿常感头痛，有时也会感觉胸骨下疼痛。患儿常会觉得“胸脯疼”。
一般支原体感染的潜伏期为1-3周，不同感染期症状不同。
1、典型的急性期症状：尿道刺痛，不同程度的尿急及尿频、排尿刺痛，特别是当尿液较为浓缩的时候明显。尿道口轻度红肿，分泌物稀薄，量少，为浆液性或脓性，多需用力挤压尿道才见分泌物溢出，常于晨起尿道口有少量粘液性分泌物或仅有痂膜封口，或见污秽裤裆。
2、亚急性期症状：常合并前列腺感染，患者常出现会阴部胀痛、腰酸、双股内侧不适感或在做提肛动作时有自会阴向股内侧发散的刺痛感。
