小儿慢性胃炎最明显的症状就是消化不良，经常会有便秘或者腹泻等症状，吃东西后经常排气、肚子发胀、不消化；有的会有积食，发烧等症状。长期消化不良，会导致孩子出现腹痛、腹泻等症状，早期腹痛一般不算明显，但是按压时通常会有钝痛感。炎症发作严重的还会恶心、呕吐，甚至上吐下泻和进食困难。
慢性胃炎如果没有得到及时的治疗，炎症反复发作，会影响孩子的食欲，吃东西的时候感觉恶心，身体的不适也会引起情绪不佳，甚至烦躁、哭闹。长期没有食欲，会影响孩子的正常发育，营养跟不上，容易出现体重明显减轻、消瘦、脸色苍白等症状，严重的还会贫血。
慢性胃炎还表现为大便异常，有的患儿经常便秘，大便发黑，味道比较臭；单纯大便发黑不一定就确定是慢性胃炎，需要结合其他的症状来判断。如有这些症状表现，应及时到医院检查，不要乱用药物，药物不对症，不仅不能缓解症状，还可能引起其他问题出现。
小儿慢性胃炎还会出现反复腹痛的症状，通常这种疼痛并没有规律性，大多会在进食后出现症状加重的现象。而且疼痛部位也不明确，大多数患儿会感觉脐周疼痛。当小婴儿出现腹痛时，他们通常会表现的特别不安，而且会影响正常进食，除此之外，在临床上，有些患儿还会出现不同程度的嗳气、早饱、恶心、反酸等症状。如果吃硬、冷、辛辣等食物，会加重疾病的症状。
部分小儿慢性胃炎患儿会出现食欲不振、乏力、消瘦及头晕等症状，如果出现胃糜烂的患儿可能会出现黑便体征，但是这种症状不是很明显，在做检查时可以发现压痛，其部位可在中上腹或脐周，而且范围较广泛。
