斜视眼在家族中遗传不是全体成员，这种缺陷往往是间接遗传到下一代子女身上。一般出生6个月内发生斜视称先天性斜视，它不具备建立双眼视物的基本条件，对视功能的发育危害最大。
这种斜视多由先天眼外肌肉的位置发育异常，眼外肌本身发育异常，中胚叶分化不全，眼肌分离不良，肌鞘异常及纤维化等解剖上的缺陷或支配肌肉的神经麻痹所致。也有的由于生产过程中，使用产钳造成婴儿头面部损伤或母亲生产时用力过度致胎儿颅压升高产生大脑点状出血，而出血刚好在支配眼球运动的神经核处引起眼外肌麻痹。
发育不完善比如断奶、换牙、惊吓、震动等，都可以使大脑的融合功能受到破坏造成斜视。有的儿童生了一场大病，发了几天高烧之后，眼睛斜了。有的儿童从床上掉在地上摔了一下，眼睛就斜了。
一般多表现为共同性斜视，如果集合过强或外展不足或两者同时存在就产生了内斜;相反外展过强，集合不足或者两者同时存在，就产生了外斜。
由于儿童眼球小，眼轴短，多为远视眼，又因儿童角膜及晶体屈折力大，睫状肌收缩力强，即调节力强。这样的儿童想看清物体就需要更多的调节力，同时双眼也用力向内转产生了过量辐辏，容易引起内斜视，这种内斜视称调节性内斜。
