这是取得刷牙效果非常重要的环节。菌斑显示剂法是辨认菌斑的可靠方法，但家庭很少使用。通常菌斑容易滞留的部位有托槽周围和龈缘处，这两个部位是格外需要刷干净的部位。
口腔的解剖结构复杂，凹凸不平的区域较多，尤其是牙齿的邻接面和最后磨牙的远中面，是最易堆积菌斑的部位。对磨牙远中邻面刷洗时，从一个方向或从不同的方向、角度，尽量把刷毛伸进并与牙面紧贴，才可能对它做清刷。托槽周围可以将刷毛稍微倾斜致其包围托槽并嵌于弓丝下方，做轻微颤动。龈缘部位则要将刷毛倾斜，使刷毛头部轻入龈沟，轻轻颤动。
口腔结构较复杂，仅用一种刷牙方法，一个刷牙动作，是难以去净口内菌斑的。人们刷牙时，牙刷头的基本动作有纵向、横向、旋转和颤动四种，以完成刷牙过程。
上述各种刷牙方法在熟练的基础上也可以综合起来，如先做水平刷，去除大块滞留于弓丝周围的食物，然后分部位做竖刷，刷净大部分牙面；然后再做水平微颤法，精细刷托槽周围和龈缘，几种方法联合使用，择其优点，保持口腔卫生。
可选用震颤式电动牙刷
也可配合正畸专用牙线清洁牙面和牙间隙，但不推荐使用旋转式电动牙刷。
刷牙后对镜自查自检，对于顽固的卫生死角要重点刷干净。
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